首都经济贸易大学校医院前身创建于1956年2月北京劳动学院医务室。经过几代人的建设从当年的医务室发展成为现今承担医疗、预防、保健、健康教育、公费医疗管理、计划生育管理等多项职能为一体的综合门诊部。 是首都高校首批准入社会医疗保险的定点医疗机构。医保定点医疗机构名称及编码 校本部：首都经济贸易大学西校区门诊部，编码：06141003 ；红庙校区：首都经济贸易大学门诊部，编码：05111003 。
校医院在职人员30人，其中医疗专业技术人员26人，副主任医师4人，主治医师、主管护师等中级医技人员17人，初级医技人员5人。所有专业技术人员均具有执业资格，医师和护士都接受过全科培训并取得相应资格和执业证书。
校医院设有急诊、内科、外科、妇科、中医科、口腔科、预防保健科、检验科、放射科、B超室、理疗室、慢病管理、药房、注射室、输液室、换药室等诊疗科室。配备有先进的检查与治疗设备，如数字式彩色B超机、数字X光拍片机、全自动血液生化分析仪、血球分析仪、尿液分析仪、幽门螺旋杆菌检测仪、全自动声波骨密度仪、动态心电图分析仪（Holter）及动态血压监测仪、全自动动脉检测仪、人体成分分析仪，口腔数字化综合治疗设备，高中低频理疗设备，妇科光-电一体阴道镜等医疗设备。
2013年,学校加大投入对校医院进行了改扩建，目前校医院的建筑面积达2031㎡，医疗业务用房60余间，校医院加强科室建设，增加诊疗项目，增设中医科及口腔科，为广大师生提供了舒适的就医环境和优质的医疗服务。
校医院医务人员在工作中始终贯彻预防为主的卫生工作方针，防治结合，坚持以病人为中心，不断改进服务态度，提高服务质量，以精湛的医疗技术为全体教职员工与学生的身心健康做好医疗保障服务。